Les femmes atteintes du syndrome de Morris ont un génotype masculin, c'est-à-dire que leurs chromosomes sexuels sont XY. Cependant, elles se développent en tant que femmes et donc leur phénotype et leur apparence physique sont féminins.
Parce que l'un de leurs chromosomes sexuels est mâle (chromosome Y), les femmes atteintes du syndrome de Morris n'ont ni utérus ni ovaires. Leur système reproducteur interne n'a que des testicules atrophiés situés à l'intérieur de l'abdomen ou dans l'aine.
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